Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col4a5Q63ZW6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col4a5Q63ZW6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col4a5Q63ZW6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col4a5Q63ZW6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Col4a5Q63ZW6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col4a5Q63ZW6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col4a5Q63ZW6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col4a5Q63ZW6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Col4a5Q63ZW6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col4a5Q63ZW6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col4a5Q63ZW6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col4a5Q63ZW6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Col4a5Q63ZW6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Col4a5Q63ZW6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col4a5Q63ZW6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col4a5Q63ZW6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col4a5Q63ZW6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col4a5Q63ZW6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col4a5Q63ZW6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col4a5Q63ZW6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col4a5Q63ZW6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col4a5Q63ZW6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Col4a5Q63ZW6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Col4a5Q63ZW6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col4a5Q63ZW6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Col4a5Q63ZW6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Col4a5Q63ZW6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Col4a5Q63ZW6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Col4a5Q63ZW6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col4a5Q63ZW6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col4a5Q63ZW6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col4a5Q63ZW6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Col4a5Q63ZW6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Col4a5Q63ZW6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col4a5Q63ZW6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col4a5Q63ZW6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col4a5Q63ZW6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Col4a5Q63ZW6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col4a5Q63ZW6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col4a5Q63ZW6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col4a5Q63ZW6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms