Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrmsQ62270 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrmsQ62270 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrmsQ62270 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrmsQ62270 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrmsQ62270 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrmsQ62270 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrmsQ62270 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SrmsQ62270 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrmsQ62270 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrmsQ62270 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrmsQ62270 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrmsQ62270 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrmsQ62270 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SrmsQ62270 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SrmsQ62270 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrmsQ62270 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SrmsQ62270 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrmsQ62270 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrmsQ62270 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SrmsQ62270 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SrmsQ62270 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SrmsQ62270 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrmsQ62270 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrmsQ62270 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms