Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sall3Q62255 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sall3Q62255 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Sall3Q62255 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sall3Q62255 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sall3Q62255 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sall3Q62255 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sall3Q62255 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sall3Q62255 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Sall3Q62255 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Sall3Q62255 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Sall3Q62255 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sall3Q62255 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sall3Q62255 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Sall3Q62255 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Sall3Q62255 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Sall3Q62255 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Sall3Q62255 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Sall3Q62255 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Sall3Q62255 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Sall3Q62255 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Sall3Q62255 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sall3Q62255 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sall3Q62255 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sall3Q62255 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sall3Q62255 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Sall3Q62255 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Sall3Q62255 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Sall3Q62255 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Sall3Q62255 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sall3Q62255 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Sall3Q62255 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sall3Q62255 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sall3Q62255 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Sall3Q62255 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Sall3Q62255 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Sall3Q62255 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Sall3Q62255 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Sall3Q62255 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Sall3Q62255 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Sall3Q62255 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Sall3Q62255 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Sall3Q62255 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Sall3Q62255 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Sall3Q62255 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Sall3Q62255 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Sall3Q62255 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Sall3Q62255 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Sall3Q62255 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sall3Q62255 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sall3Q62255 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sall3Q62255 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Sall3Q62255 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sall3Q62255 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sall3Q62255 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sall3Q62255 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Sall3Q62255 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Sall3Q62255 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sall3Q62255 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Sall3Q62255 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Sall3Q62255 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sall3Q62255 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sall3Q62255 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Sall3Q62255 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Sall3Q62255 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sall3Q62255 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sall3Q62255 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms