Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sycp1Q62209 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sycp1Q62209 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sycp1Q62209 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sycp1Q62209 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sycp1Q62209 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sycp1Q62209 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sycp1Q62209 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sycp1Q62209 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sycp1Q62209 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sycp1Q62209 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sycp1Q62209 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sycp1Q62209 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sycp1Q62209 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp1Q62209 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sycp1Q62209 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sycp1Q62209 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sycp1Q62209 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sycp1Q62209 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sycp1Q62209 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sycp1Q62209 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Sycp1Q62209 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sycp1Q62209 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sycp1Q62209 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sycp1Q62209 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sycp1Q62209 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sycp1Q62209 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sycp1Q62209 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp1Q62209 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sycp1Q62209 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sycp1Q62209 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp1Q62209 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp1Q62209 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sycp1Q62209 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sycp1Q62209 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sycp1Q62209 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sycp1Q62209 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sycp1Q62209 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp1Q62209 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp1Q62209 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp1Q62209 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp1Q62209 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp1Q62209 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp1Q62209 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sycp1Q62209 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sycp1Q62209 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sycp1Q62209 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sycp1Q62209 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sycp1Q62209 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp1Q62209 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp1Q62209 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp1Q62209 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Sycp1Q62209 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sycp1Q62209 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Sycp1Q62209 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sycp1Q62209 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Sycp1Q62209 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sycp1Q62209 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sycp1Q62209 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sycp1Q62209 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sycp1Q62209 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sycp1Q62209 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sycp1Q62209 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sycp1Q62209 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp1Q62209 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sycp1Q62209 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sycp1Q62209 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sycp1Q62209 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp1Q62209 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp1Q62209 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp1Q62209 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp1Q62209 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp1Q62209 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sycp1Q62209 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sycp1Q62209 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms