Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Aldh1a2Q62148 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Aldh1a2Q62148 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Aldh1a2Q62148 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Aldh1a2Q62148 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Aldh1a2Q62148 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Aldh1a2Q62148 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Aldh1a2Q62148 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Aldh1a2Q62148 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Aldh1a2Q62148 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Aldh1a2Q62148 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Aldh1a2Q62148 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Aldh1a2Q62148 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Aldh1a2Q62148 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Aldh1a2Q62148 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Aldh1a2Q62148 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms