Protein–RNA interactions for Protein: Q61762

Kcna5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna5Q61762 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna5Q61762 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna5Q61762 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna5Q61762 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna5Q61762 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms