Protein–RNA interactions for Protein: Q61762

Kcna5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna5Q61762 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kcna5Q61762 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcna5Q61762 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kcna5Q61762 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcna5Q61762 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna5Q61762 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna5Q61762 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna5Q61762 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna5Q61762 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna5Q61762 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms