Protein–RNA interactions for Protein: Q61663

Tlx2, T-cell leukemia homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx2Q61663 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlx2Q61663 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlx2Q61663 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlx2Q61663 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlx2Q61663 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlx2Q61663 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlx2Q61663 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlx2Q61663 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlx2Q61663 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlx2Q61663 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlx2Q61663 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlx2Q61663 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlx2Q61663 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlx2Q61663 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlx2Q61663 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlx2Q61663 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx2Q61663 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlx2Q61663 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlx2Q61663 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlx2Q61663 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms