Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AlcamQ61490 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AlcamQ61490 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AlcamQ61490 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AlcamQ61490 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
AlcamQ61490 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AlcamQ61490 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AlcamQ61490 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AlcamQ61490 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AlcamQ61490 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AlcamQ61490 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AlcamQ61490 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AlcamQ61490 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AlcamQ61490 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
AlcamQ61490 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AlcamQ61490 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AlcamQ61490 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AlcamQ61490 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
AlcamQ61490 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AlcamQ61490 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AlcamQ61490 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AlcamQ61490 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AlcamQ61490 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AlcamQ61490 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlcamQ61490 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlcamQ61490 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AlcamQ61490 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AlcamQ61490 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AlcamQ61490 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AlcamQ61490 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AlcamQ61490 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
AlcamQ61490 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AlcamQ61490 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AlcamQ61490 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AlcamQ61490 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AlcamQ61490 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AlcamQ61490 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AlcamQ61490 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AlcamQ61490 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AlcamQ61490 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AlcamQ61490 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AlcamQ61490 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AlcamQ61490 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AlcamQ61490 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AlcamQ61490 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AlcamQ61490 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
AlcamQ61490 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AlcamQ61490 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AlcamQ61490 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AlcamQ61490 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AlcamQ61490 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AlcamQ61490 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AlcamQ61490 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AlcamQ61490 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AlcamQ61490 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AlcamQ61490 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AlcamQ61490 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AlcamQ61490 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AlcamQ61490 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AlcamQ61490 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AlcamQ61490 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AlcamQ61490 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AlcamQ61490 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlcamQ61490 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AlcamQ61490 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms