Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox17Q61473 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox17Q61473 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox17Q61473 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox17Q61473 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox17Q61473 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox17Q61473 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox17Q61473 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sox17Q61473 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox17Q61473 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox17Q61473 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox17Q61473 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox17Q61473 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms