Protein–RNA interactions for Protein: Q60953

Pml, Protein PML, mousemouse

Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmlQ60953 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PmlQ60953 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PmlQ60953 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PmlQ60953 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PmlQ60953 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PmlQ60953 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PmlQ60953 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PmlQ60953 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PmlQ60953 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PmlQ60953 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PmlQ60953 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PmlQ60953 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PmlQ60953 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PmlQ60953 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PmlQ60953 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PmlQ60953 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PmlQ60953 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PmlQ60953 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PmlQ60953 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PmlQ60953 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PmlQ60953 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PmlQ60953 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PmlQ60953 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PmlQ60953 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PmlQ60953 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PmlQ60953 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PmlQ60953 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PmlQ60953 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PmlQ60953 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PmlQ60953 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PmlQ60953 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PmlQ60953 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PmlQ60953 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PmlQ60953 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PmlQ60953 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PmlQ60953 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PmlQ60953 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PmlQ60953 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PmlQ60953 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PmlQ60953 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PmlQ60953 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PmlQ60953 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PmlQ60953 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PmlQ60953 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PmlQ60953 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PmlQ60953 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PmlQ60953 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PmlQ60953 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PmlQ60953 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PmlQ60953 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PmlQ60953 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PmlQ60953 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PmlQ60953 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PmlQ60953 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PmlQ60953 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PmlQ60953 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PmlQ60953 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PmlQ60953 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PmlQ60953 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PmlQ60953 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PmlQ60953 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms