Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vdac1Q60932 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vdac1Q60932 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vdac1Q60932 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vdac1Q60932 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vdac1Q60932 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vdac1Q60932 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vdac1Q60932 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vdac1Q60932 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vdac1Q60932 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vdac1Q60932 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138 ms