Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfaip3Q60769 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfaip3Q60769 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfaip3Q60769 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfaip3Q60769 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip3Q60769 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip3Q60769 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip3Q60769 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfaip3Q60769 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfaip3Q60769 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip3Q60769 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfaip3Q60769 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfaip3Q60769 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfaip3Q60769 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip3Q60769 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfaip3Q60769 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfaip3Q60769 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip3Q60769 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfaip3Q60769 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfaip3Q60769 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfaip3Q60769 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfaip3Q60769 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip3Q60769 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip3Q60769 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip3Q60769 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfaip3Q60769 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfaip3Q60769 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfaip3Q60769 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfaip3Q60769 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip3Q60769 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms