Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mkrn3Q60764 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Mkrn3Q60764 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mkrn3Q60764 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mkrn3Q60764 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mkrn3Q60764 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mkrn3Q60764 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mkrn3Q60764 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mkrn3Q60764 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mkrn3Q60764 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mkrn3Q60764 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mkrn3Q60764 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mkrn3Q60764 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mkrn3Q60764 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mkrn3Q60764 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mkrn3Q60764 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Mkrn3Q60764 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mkrn3Q60764 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms