Protein–RNA interactions for Protein: Q60738

Slc30a1, Zinc transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc30a1Q60738 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc30a1Q60738 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc30a1Q60738 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc30a1Q60738 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc30a1Q60738 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc30a1Q60738 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc30a1Q60738 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc30a1Q60738 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc30a1Q60738 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc30a1Q60738 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc30a1Q60738 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc30a1Q60738 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc30a1Q60738 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc30a1Q60738 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc30a1Q60738 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc30a1Q60738 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc30a1Q60738 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc30a1Q60738 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms