Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm1Q60636 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prdm1Q60636 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm1Q60636 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prdm1Q60636 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prdm1Q60636 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prdm1Q60636 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm1Q60636 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm1Q60636 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Prdm1Q60636 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prdm1Q60636 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prdm1Q60636 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm1Q60636 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prdm1Q60636 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prdm1Q60636 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prdm1Q60636 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm1Q60636 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prdm1Q60636 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm1Q60636 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm1Q60636 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prdm1Q60636 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Prdm1Q60636 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prdm1Q60636 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prdm1Q60636 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm1Q60636 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm1Q60636 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prdm1Q60636 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm1Q60636 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prdm1Q60636 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm1Q60636 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm1Q60636 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm1Q60636 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prdm1Q60636 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prdm1Q60636 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm1Q60636 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prdm1Q60636 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prdm1Q60636 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prdm1Q60636 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm1Q60636 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm1Q60636 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prdm1Q60636 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm1Q60636 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prdm1Q60636 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm1Q60636 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prdm1Q60636 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prdm1Q60636 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prdm1Q60636 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm1Q60636 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prdm1Q60636 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm1Q60636 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm1Q60636 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prdm1Q60636 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms