Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cxcl17Q5UW37 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cxcl17Q5UW37 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxcl17Q5UW37 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxcl17Q5UW37 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cxcl17Q5UW37 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cxcl17Q5UW37 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcl17Q5UW37 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcl17Q5UW37 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcl17Q5UW37 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcl17Q5UW37 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcl17Q5UW37 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcl17Q5UW37 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cxcl17Q5UW37 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cxcl17Q5UW37 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cxcl17Q5UW37 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxcl17Q5UW37 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxcl17Q5UW37 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cxcl17Q5UW37 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cxcl17Q5UW37 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cxcl17Q5UW37 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cxcl17Q5UW37 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cxcl17Q5UW37 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cxcl17Q5UW37 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cxcl17Q5UW37 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cxcl17Q5UW37 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cxcl17Q5UW37 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cxcl17Q5UW37 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cxcl17Q5UW37 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cxcl17Q5UW37 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cxcl17Q5UW37 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cxcl17Q5UW37 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl17Q5UW37 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cxcl17Q5UW37 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl17Q5UW37 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl17Q5UW37 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cxcl17Q5UW37 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cxcl17Q5UW37 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cxcl17Q5UW37 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl17Q5UW37 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl17Q5UW37 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cxcl17Q5UW37 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl17Q5UW37 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcl17Q5UW37 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcl17Q5UW37 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcl17Q5UW37 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl17Q5UW37 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl17Q5UW37 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl17Q5UW37 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl17Q5UW37 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl17Q5UW37 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcl17Q5UW37 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcl17Q5UW37 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcl17Q5UW37 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcl17Q5UW37 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cxcl17Q5UW37 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl17Q5UW37 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms