Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYH2

Tmem199, Transmembrane protein 199, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem199Q5SYH2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmem199Q5SYH2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmem199Q5SYH2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmem199Q5SYH2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmem199Q5SYH2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmem199Q5SYH2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmem199Q5SYH2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem199Q5SYH2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem199Q5SYH2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmem199Q5SYH2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmem199Q5SYH2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmem199Q5SYH2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmem199Q5SYH2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem199Q5SYH2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem199Q5SYH2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmem199Q5SYH2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem199Q5SYH2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmem199Q5SYH2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem199Q5SYH2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem199Q5SYH2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem199Q5SYH2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem199Q5SYH2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem199Q5SYH2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem199Q5SYH2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem199Q5SYH2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem199Q5SYH2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem199Q5SYH2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem199Q5SYH2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem199Q5SYH2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem199Q5SYH2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem199Q5SYH2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem199Q5SYH2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem199Q5SYH2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem199Q5SYH2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem199Q5SYH2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem199Q5SYH2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem199Q5SYH2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem199Q5SYH2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem199Q5SYH2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem199Q5SYH2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem199Q5SYH2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem199Q5SYH2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem199Q5SYH2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem199Q5SYH2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem199Q5SYH2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem199Q5SYH2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem199Q5SYH2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem199Q5SYH2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms