Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AbrQ5SSL4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AbrQ5SSL4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AbrQ5SSL4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AbrQ5SSL4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AbrQ5SSL4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AbrQ5SSL4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AbrQ5SSL4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AbrQ5SSL4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AbrQ5SSL4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AbrQ5SSL4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AbrQ5SSL4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AbrQ5SSL4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AbrQ5SSL4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms