Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
5730522E02RikQ5SP45 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
5730522E02RikQ5SP45 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
5730522E02RikQ5SP45 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
5730522E02RikQ5SP45 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
5730522E02RikQ5SP45 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
5730522E02RikQ5SP45 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
5730522E02RikQ5SP45 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
5730522E02RikQ5SP45 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5730522E02RikQ5SP45 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5730522E02RikQ5SP45 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
5730522E02RikQ5SP45 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
5730522E02RikQ5SP45 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
5730522E02RikQ5SP45 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
5730522E02RikQ5SP45 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms