Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20cQ5MJS3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20cQ5MJS3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20cQ5MJS3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20cQ5MJS3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20cQ5MJS3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20cQ5MJS3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20cQ5MJS3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20cQ5MJS3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20cQ5MJS3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20cQ5MJS3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam20cQ5MJS3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam20cQ5MJS3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam20cQ5MJS3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam20cQ5MJS3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam20cQ5MJS3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam20cQ5MJS3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam20cQ5MJS3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam20cQ5MJS3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms