Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E7

Zc3h12a, Endoribonuclease ZC3H12A, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12aQ5D1E7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h12aQ5D1E7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h12aQ5D1E7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zc3h12aQ5D1E7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h12aQ5D1E7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zc3h12aQ5D1E7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zc3h12aQ5D1E7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zc3h12aQ5D1E7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Zc3h12aQ5D1E7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms