Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1td1Q587J6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
L1td1Q587J6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1td1Q587J6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
L1td1Q587J6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
L1td1Q587J6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
L1td1Q587J6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
L1td1Q587J6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
L1td1Q587J6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
L1td1Q587J6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
L1td1Q587J6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
L1td1Q587J6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
L1td1Q587J6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
L1td1Q587J6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
L1td1Q587J6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
L1td1Q587J6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
L1td1Q587J6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
L1td1Q587J6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1td1Q587J6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1td1Q587J6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1td1Q587J6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1td1Q587J6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1td1Q587J6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
L1td1Q587J6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
L1td1Q587J6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1td1Q587J6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1td1Q587J6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
L1td1Q587J6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
L1td1Q587J6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
L1td1Q587J6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
L1td1Q587J6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
L1td1Q587J6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
L1td1Q587J6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
L1td1Q587J6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
L1td1Q587J6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
L1td1Q587J6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
L1td1Q587J6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
L1td1Q587J6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
L1td1Q587J6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
L1td1Q587J6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
L1td1Q587J6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
L1td1Q587J6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
L1td1Q587J6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms