Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Eme2Q56A04 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Eme2Q56A04 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eme2Q56A04 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eme2Q56A04 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Eme2Q56A04 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Eme2Q56A04 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Eme2Q56A04 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Eme2Q56A04 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Eme2Q56A04 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Eme2Q56A04 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Eme2Q56A04 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Eme2Q56A04 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Eme2Q56A04 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Eme2Q56A04 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Eme2Q56A04 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Eme2Q56A04 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Eme2Q56A04 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Eme2Q56A04 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Eme2Q56A04 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Eme2Q56A04 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Eme2Q56A04 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Eme2Q56A04 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Eme2Q56A04 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Eme2Q56A04 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Eme2Q56A04 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Eme2Q56A04 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Eme2Q56A04 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Eme2Q56A04 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Eme2Q56A04 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Eme2Q56A04 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Eme2Q56A04 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Eme2Q56A04 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Eme2Q56A04 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Eme2Q56A04 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Eme2Q56A04 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Eme2Q56A04 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Eme2Q56A04 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Eme2Q56A04 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Eme2Q56A04 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Eme2Q56A04 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Eme2Q56A04 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Eme2Q56A04 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Eme2Q56A04 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Eme2Q56A04 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Eme2Q56A04 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Eme2Q56A04 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Eme2Q56A04 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Eme2Q56A04 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Eme2Q56A04 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Eme2Q56A04 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Eme2Q56A04 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Eme2Q56A04 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Eme2Q56A04 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Eme2Q56A04 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Eme2Q56A04 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Eme2Q56A04 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Eme2Q56A04 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Eme2Q56A04 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Eme2Q56A04 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Eme2Q56A04 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Eme2Q56A04 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Eme2Q56A04 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Eme2Q56A04 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Eme2Q56A04 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Eme2Q56A04 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Eme2Q56A04 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms