Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddx49Q4FZF3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddx49Q4FZF3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddx49Q4FZF3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddx49Q4FZF3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddx49Q4FZF3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ddx49Q4FZF3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ddx49Q4FZF3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ddx49Q4FZF3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ddx49Q4FZF3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddx49Q4FZF3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddx49Q4FZF3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ddx49Q4FZF3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx49Q4FZF3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx49Q4FZF3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx49Q4FZF3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ddx49Q4FZF3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ddx49Q4FZF3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ddx49Q4FZF3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ddx49Q4FZF3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddx49Q4FZF3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ddx49Q4FZF3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ddx49Q4FZF3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ddx49Q4FZF3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ddx49Q4FZF3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ddx49Q4FZF3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ddx49Q4FZF3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ddx49Q4FZF3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ddx49Q4FZF3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddx49Q4FZF3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddx49Q4FZF3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ddx49Q4FZF3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ddx49Q4FZF3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx49Q4FZF3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx49Q4FZF3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx49Q4FZF3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddx49Q4FZF3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddx49Q4FZF3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddx49Q4FZF3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddx49Q4FZF3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx49Q4FZF3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddx49Q4FZF3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx49Q4FZF3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx49Q4FZF3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx49Q4FZF3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddx49Q4FZF3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms