Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mtmr11Q3V1L6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mtmr11Q3V1L6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mtmr11Q3V1L6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mtmr11Q3V1L6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mtmr11Q3V1L6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtmr11Q3V1L6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtmr11Q3V1L6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtmr11Q3V1L6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtmr11Q3V1L6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mtmr11Q3V1L6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mtmr11Q3V1L6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mtmr11Q3V1L6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mtmr11Q3V1L6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr11Q3V1L6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr11Q3V1L6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr11Q3V1L6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mtmr11Q3V1L6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms