Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bbof1Q3V079 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bbof1Q3V079 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bbof1Q3V079 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Bbof1Q3V079 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bbof1Q3V079 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bbof1Q3V079 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bbof1Q3V079 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bbof1Q3V079 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Bbof1Q3V079 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bbof1Q3V079 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bbof1Q3V079 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms