Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnga4Q3UW12 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga4Q3UW12 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga4Q3UW12 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga4Q3UW12 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga4Q3UW12 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga4Q3UW12 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga4Q3UW12 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga4Q3UW12 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga4Q3UW12 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnga4Q3UW12 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga4Q3UW12 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga4Q3UW12 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga4Q3UW12 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga4Q3UW12 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga4Q3UW12 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cnga4Q3UW12 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnga4Q3UW12 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms