Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Skap1Q3UUV5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Skap1Q3UUV5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skap1Q3UUV5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skap1Q3UUV5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Skap1Q3UUV5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Skap1Q3UUV5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms