Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ2

Ubtfl1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtfl1Q3USZ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubtfl1Q3USZ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubtfl1Q3USZ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubtfl1Q3USZ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubtfl1Q3USZ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubtfl1Q3USZ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubtfl1Q3USZ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubtfl1Q3USZ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubtfl1Q3USZ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubtfl1Q3USZ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubtfl1Q3USZ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubtfl1Q3USZ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubtfl1Q3USZ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubtfl1Q3USZ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubtfl1Q3USZ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubtfl1Q3USZ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubtfl1Q3USZ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ubtfl1Q3USZ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubtfl1Q3USZ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubtfl1Q3USZ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubtfl1Q3USZ2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubtfl1Q3USZ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubtfl1Q3USZ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubtfl1Q3USZ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubtfl1Q3USZ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubtfl1Q3USZ2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubtfl1Q3USZ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubtfl1Q3USZ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubtfl1Q3USZ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubtfl1Q3USZ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ubtfl1Q3USZ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubtfl1Q3USZ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms