Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPF5

Zc3hav1, Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3hav1Q3UPF5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3hav1Q3UPF5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3hav1Q3UPF5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3hav1Q3UPF5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3hav1Q3UPF5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3hav1Q3UPF5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3hav1Q3UPF5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3hav1Q3UPF5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3hav1Q3UPF5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3hav1Q3UPF5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zc3hav1Q3UPF5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3hav1Q3UPF5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3hav1Q3UPF5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3hav1Q3UPF5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zc3hav1Q3UPF5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zc3hav1Q3UPF5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3hav1Q3UPF5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3hav1Q3UPF5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3hav1Q3UPF5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3hav1Q3UPF5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3hav1Q3UPF5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3hav1Q3UPF5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3hav1Q3UPF5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3hav1Q3UPF5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3hav1Q3UPF5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3hav1Q3UPF5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3hav1Q3UPF5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3hav1Q3UPF5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3hav1Q3UPF5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3hav1Q3UPF5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3hav1Q3UPF5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3hav1Q3UPF5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3hav1Q3UPF5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3hav1Q3UPF5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3hav1Q3UPF5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3hav1Q3UPF5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3hav1Q3UPF5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3hav1Q3UPF5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3hav1Q3UPF5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3hav1Q3UPF5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3hav1Q3UPF5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3hav1Q3UPF5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3hav1Q3UPF5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3hav1Q3UPF5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3hav1Q3UPF5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms