Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ceacam5Q3UKK2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ceacam5Q3UKK2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ceacam5Q3UKK2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ceacam5Q3UKK2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ceacam5Q3UKK2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ceacam5Q3UKK2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ceacam5Q3UKK2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ceacam5Q3UKK2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ceacam5Q3UKK2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ceacam5Q3UKK2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ceacam5Q3UKK2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ceacam5Q3UKK2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ceacam5Q3UKK2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ceacam5Q3UKK2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ceacam5Q3UKK2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ceacam5Q3UKK2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ceacam5Q3UKK2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ceacam5Q3UKK2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ceacam5Q3UKK2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ceacam5Q3UKK2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ceacam5Q3UKK2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ceacam5Q3UKK2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ceacam5Q3UKK2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ceacam5Q3UKK2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ceacam5Q3UKK2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ceacam5Q3UKK2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ceacam5Q3UKK2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ceacam5Q3UKK2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ceacam5Q3UKK2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ceacam5Q3UKK2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ceacam5Q3UKK2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ceacam5Q3UKK2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ceacam5Q3UKK2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ceacam5Q3UKK2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms