Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Parp8Q3UD82 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Parp8Q3UD82 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp8Q3UD82 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp8Q3UD82 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms