Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gse1Q3U3C9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gse1Q3U3C9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gse1Q3U3C9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gse1Q3U3C9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gse1Q3U3C9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gse1Q3U3C9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172 ms