Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TraddQ3U0V2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TraddQ3U0V2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TraddQ3U0V2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TraddQ3U0V2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TraddQ3U0V2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TraddQ3U0V2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms