Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rufy4Q3TYX8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rufy4Q3TYX8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rufy4Q3TYX8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rufy4Q3TYX8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rufy4Q3TYX8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rufy4Q3TYX8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rufy4Q3TYX8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rufy4Q3TYX8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rufy4Q3TYX8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rufy4Q3TYX8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rufy4Q3TYX8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rufy4Q3TYX8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rufy4Q3TYX8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rufy4Q3TYX8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rufy4Q3TYX8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rufy4Q3TYX8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rufy4Q3TYX8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rufy4Q3TYX8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rufy4Q3TYX8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rufy4Q3TYX8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rufy4Q3TYX8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rufy4Q3TYX8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rufy4Q3TYX8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rufy4Q3TYX8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rufy4Q3TYX8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rufy4Q3TYX8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rufy4Q3TYX8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rufy4Q3TYX8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rufy4Q3TYX8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rufy4Q3TYX8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rufy4Q3TYX8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rufy4Q3TYX8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rufy4Q3TYX8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rufy4Q3TYX8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rufy4Q3TYX8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rufy4Q3TYX8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rufy4Q3TYX8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rufy4Q3TYX8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rufy4Q3TYX8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rufy4Q3TYX8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rufy4Q3TYX8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rufy4Q3TYX8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rufy4Q3TYX8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rufy4Q3TYX8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rufy4Q3TYX8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rufy4Q3TYX8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rufy4Q3TYX8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms