Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp13a5Q3TYU2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp13a5Q3TYU2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a5Q3TYU2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp13a5Q3TYU2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp13a5Q3TYU2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp13a5Q3TYU2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp13a5Q3TYU2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp13a5Q3TYU2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp13a5Q3TYU2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp13a5Q3TYU2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp13a5Q3TYU2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp13a5Q3TYU2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp13a5Q3TYU2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp13a5Q3TYU2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp13a5Q3TYU2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp13a5Q3TYU2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a5Q3TYU2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a5Q3TYU2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp13a5Q3TYU2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp13a5Q3TYU2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp13a5Q3TYU2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp13a5Q3TYU2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp13a5Q3TYU2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp13a5Q3TYU2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp13a5Q3TYU2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp13a5Q3TYU2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp13a5Q3TYU2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp13a5Q3TYU2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp13a5Q3TYU2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a5Q3TYU2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a5Q3TYU2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a5Q3TYU2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a5Q3TYU2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp13a5Q3TYU2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms