Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srsf6Q3TWW8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srsf6Q3TWW8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srsf6Q3TWW8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srsf6Q3TWW8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srsf6Q3TWW8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Srsf6Q3TWW8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srsf6Q3TWW8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srsf6Q3TWW8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srsf6Q3TWW8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srsf6Q3TWW8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srsf6Q3TWW8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srsf6Q3TWW8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srsf6Q3TWW8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srsf6Q3TWW8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srsf6Q3TWW8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srsf6Q3TWW8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Srsf6Q3TWW8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Srsf6Q3TWW8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srsf6Q3TWW8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srsf6Q3TWW8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srsf6Q3TWW8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms