Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tamm41Q3TUH1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tamm41Q3TUH1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tamm41Q3TUH1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tamm41Q3TUH1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms