Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3TTL0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3TTL0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3TTL0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3TTL0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3TTL0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3TTL0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3TTL0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3TTL0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3TTL0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3TTL0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3TTL0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3TTL0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3TTL0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3TTL0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3TTL0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3TTL0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3TTL0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3TTL0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3TTL0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3TTL0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3TTL0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3TTL0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3TTL0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3TTL0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3TTL0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3TTL0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3TTL0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3TTL0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3TTL0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3TTL0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3TTL0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3TTL0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3TTL0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q3TTL0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q3TTL0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3TTL0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TTL0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3TTL0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TTL0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TTL0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TTL0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3TTL0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3TTL0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3TTL0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3TTL0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3TTL0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TTL0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TTL0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TTL0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TTL0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3TTL0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3TTL0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3TTL0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms