Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTA7

Cblb, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-B, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CblbQ3TTA7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CblbQ3TTA7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CblbQ3TTA7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CblbQ3TTA7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CblbQ3TTA7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CblbQ3TTA7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CblbQ3TTA7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CblbQ3TTA7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CblbQ3TTA7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CblbQ3TTA7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CblbQ3TTA7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CblbQ3TTA7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CblbQ3TTA7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CblbQ3TTA7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CblbQ3TTA7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CblbQ3TTA7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CblbQ3TTA7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CblbQ3TTA7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CblbQ3TTA7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CblbQ3TTA7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CblbQ3TTA7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CblbQ3TTA7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CblbQ3TTA7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CblbQ3TTA7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CblbQ3TTA7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CblbQ3TTA7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CblbQ3TTA7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CblbQ3TTA7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CblbQ3TTA7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CblbQ3TTA7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CblbQ3TTA7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CblbQ3TTA7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CblbQ3TTA7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.4 ms