Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XylbQ3TNA1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XylbQ3TNA1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XylbQ3TNA1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XylbQ3TNA1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XylbQ3TNA1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XylbQ3TNA1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XylbQ3TNA1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XylbQ3TNA1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XylbQ3TNA1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XylbQ3TNA1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XylbQ3TNA1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XylbQ3TNA1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
XylbQ3TNA1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
XylbQ3TNA1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XylbQ3TNA1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XylbQ3TNA1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XylbQ3TNA1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XylbQ3TNA1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XylbQ3TNA1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XylbQ3TNA1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
XylbQ3TNA1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms