Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim43aQ3TL54 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim43aQ3TL54 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim43aQ3TL54 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim43aQ3TL54 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim43aQ3TL54 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim43aQ3TL54 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim43aQ3TL54 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim43aQ3TL54 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim43aQ3TL54 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim43aQ3TL54 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim43aQ3TL54 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim43aQ3TL54 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim43aQ3TL54 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim43aQ3TL54 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim43aQ3TL54 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim43aQ3TL54 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim43aQ3TL54 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim43aQ3TL54 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim43aQ3TL54 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim43aQ3TL54 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim43aQ3TL54 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim43aQ3TL54 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim43aQ3TL54 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms