Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf2f1Q3THK3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtf2f1Q3THK3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf2f1Q3THK3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf2f1Q3THK3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2f1Q3THK3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf2f1Q3THK3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf2f1Q3THK3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf2f1Q3THK3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf2f1Q3THK3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gtf2f1Q3THK3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gtf2f1Q3THK3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtf2f1Q3THK3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtf2f1Q3THK3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf2f1Q3THK3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf2f1Q3THK3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2f1Q3THK3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2f1Q3THK3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2f1Q3THK3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf2f1Q3THK3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf2f1Q3THK3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf2f1Q3THK3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf2f1Q3THK3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf2f1Q3THK3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2f1Q3THK3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2f1Q3THK3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf2f1Q3THK3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Gtf2f1Q3THK3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2f1Q3THK3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2f1Q3THK3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2f1Q3THK3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2f1Q3THK3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2f1Q3THK3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2f1Q3THK3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf2f1Q3THK3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf2f1Q3THK3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf2f1Q3THK3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf2f1Q3THK3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf2f1Q3THK3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gtf2f1Q3THK3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms