Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul4aQ3TCH7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul4aQ3TCH7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul4aQ3TCH7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul4aQ3TCH7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul4aQ3TCH7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul4aQ3TCH7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul4aQ3TCH7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul4aQ3TCH7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul4aQ3TCH7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul4aQ3TCH7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul4aQ3TCH7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul4aQ3TCH7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul4aQ3TCH7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cul4aQ3TCH7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cul4aQ3TCH7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cul4aQ3TCH7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul4aQ3TCH7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul4aQ3TCH7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul4aQ3TCH7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul4aQ3TCH7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul4aQ3TCH7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cul4aQ3TCH7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cul4aQ3TCH7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cul4aQ3TCH7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cul4aQ3TCH7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cul4aQ3TCH7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul4aQ3TCH7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul4aQ3TCH7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul4aQ3TCH7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul4aQ3TCH7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul4aQ3TCH7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul4aQ3TCH7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cul4aQ3TCH7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul4aQ3TCH7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cul4aQ3TCH7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cul4aQ3TCH7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul4aQ3TCH7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cul4aQ3TCH7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul4aQ3TCH7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul4aQ3TCH7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul4aQ3TCH7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul4aQ3TCH7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul4aQ3TCH7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul4aQ3TCH7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cul4aQ3TCH7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cul4aQ3TCH7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cul4aQ3TCH7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul4aQ3TCH7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul4aQ3TCH7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cul4aQ3TCH7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul4aQ3TCH7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms