Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdss1Q33DR2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdss1Q33DR2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdss1Q33DR2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdss1Q33DR2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdss1Q33DR2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdss1Q33DR2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdss1Q33DR2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdss1Q33DR2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdss1Q33DR2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdss1Q33DR2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdss1Q33DR2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdss1Q33DR2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdss1Q33DR2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdss1Q33DR2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdss1Q33DR2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdss1Q33DR2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdss1Q33DR2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdss1Q33DR2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdss1Q33DR2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdss1Q33DR2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdss1Q33DR2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdss1Q33DR2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdss1Q33DR2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdss1Q33DR2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdss1Q33DR2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdss1Q33DR2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdss1Q33DR2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdss1Q33DR2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdss1Q33DR2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdss1Q33DR2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdss1Q33DR2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pdss1Q33DR2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms