Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chrna5Q2MKA5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chrna5Q2MKA5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chrna5Q2MKA5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chrna5Q2MKA5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chrna5Q2MKA5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chrna5Q2MKA5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chrna5Q2MKA5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chrna5Q2MKA5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chrna5Q2MKA5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chrna5Q2MKA5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chrna5Q2MKA5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Chrna5Q2MKA5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chrna5Q2MKA5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chrna5Q2MKA5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chrna5Q2MKA5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chrna5Q2MKA5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chrna5Q2MKA5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chrna5Q2MKA5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chrna5Q2MKA5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chrna5Q2MKA5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chrna5Q2MKA5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chrna5Q2MKA5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chrna5Q2MKA5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chrna5Q2MKA5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Chrna5Q2MKA5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chrna5Q2MKA5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chrna5Q2MKA5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chrna5Q2MKA5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chrna5Q2MKA5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chrna5Q2MKA5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chrna5Q2MKA5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chrna5Q2MKA5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chrna5Q2MKA5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chrna5Q2MKA5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms