Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fam47cQ14BE7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam47cQ14BE7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam47cQ14BE7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam47cQ14BE7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam47cQ14BE7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam47cQ14BE7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam47cQ14BE7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms