Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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