Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

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Length 764 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 REX2YLR059C 810 nt8.58□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.57□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 CDD1YLR245C 429 nt8.57□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 THI3YDL080C 1830 nt8.57□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 ALD5YER073W 1563 nt8.56□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 PAR32YDL173W 888 nt8.56□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.56□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.56□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 NME1NME1 340 nt8.56□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 YBR232CYBR232C 360 nt8.56□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 FRA1YLL029W 2250 nt8.56□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 ADH3YMR083W 1128 nt8.55□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 PTC6YCR079W 1329 nt8.54□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 GGA2YHR108W 1758 nt8.54□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 GAS1YMR307W 1680 nt8.54□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 YRF1-2YER190W 5046 nt8.53□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 PHB2YGR231C 933 nt8.53□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 MOB1YIL106W 945 nt8.53□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 FSH2YMR222C 672 nt8.53□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 YMC2YBR104W 990 nt8.53□□□□□ -1.04
AVL9Q12500 YBL095WYBL095W 813 nt8.52□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 SDS24YBR214W 1584 nt8.51□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 SEN2YLR105C 1134 nt8.49□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.49□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 VBA3YCL069W 1377 nt8.48□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.48□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.48□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.48□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.48□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.48□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.48□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.48□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.48□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.48□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.48□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.48□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 AAT1YKL106W 1356 nt8.48□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 MTO1YGL236C 2010 nt8.47□□□□□ -1.05
AVL9Q12500 YPT11YNL304W 1254 nt8.46□□□□□ -1.06
AVL9Q12500 IPL1YPL209C 1104 nt8.46□□□□□ -1.06
AVL9Q12500 NBA1YOL070C 1506 nt8.44□□□□□ -1.06
AVL9Q12500 YJL064WYJL064W 396 nt8.44□□□□□ -1.06
AVL9Q12500 MRS4YKR052C 915 nt8.44□□□□□ -1.06
AVL9Q12500 ENO1YGR254W 1314 nt8.44□□□□□ -1.06
AVL9Q12500 TRP2YER090W 1524 nt8.44□□□□□ -1.06
AVL9Q12500 FLX1YIL134W 936 nt8.43□□□□□ -1.06
AVL9Q12500 EMC3YKL207W 762 nt8.42□□□□□ -1.06
AVL9Q12500 YOR072WYOR072W 315 nt8.42□□□□□ -1.06
AVL9Q12500 FET5YFL041W 1869 nt8.42□□□□□ -1.06
AVL9Q12500 GNP1YDR508C 1992 nt8.42□□□□□ -1.06
AVL9Q12500 YCR025CYCR025C 411 nt8.4□□□□□ -1.06
AVL9Q12500 TPN1YGL186C 1740 nt8.4□□□□□ -1.07
AVL9Q12500 THI6YPL214C 1623 nt8.4□□□□□ -1.07
AVL9Q12500 RSM7YJR113C 744 nt8.39□□□□□ -1.07
AVL9Q12500 YFR020WYFR020W 699 nt8.38□□□□□ -1.07
AVL9Q12500 CYC3YAL039C 810 nt8.38□□□□□ -1.07
AVL9Q12500 YLR280CYLR280C 351 nt8.38□□□□□ -1.07
AVL9Q12500 LYS20YDL182W 1287 nt8.37□□□□□ -1.07
AVL9Q12500 YJL009WYJL009W 327 nt8.37□□□□□ -1.07
AVL9Q12500 YJR149WYJR149W 1215 nt8.37□□□□□ -1.07
AVL9Q12500 AAC3YBR085W 924 nt8.37□□□□□ -1.07
AVL9Q12500 PAU19YMR325W 375 nt8.36□□□□□ -1.07
AVL9Q12500 Q0010Q0010 387 nt8.36□□□□□ -1.07
AVL9Q12500 snR86snR86 1004 nt8.34□□□□□ -1.07
AVL9Q12500 MEP1YGR121C 1479 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.33□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 HXT11YOL156W 1704 nt8.32□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 TMS1YDR105C 1422 nt8.32□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 NAP1YKR048C 1254 nt8.32□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 ERO1YML130C 1692 nt8.31□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 YDR306CYDR306C 1437 nt8.29□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 SRM1YGL097W 1449 nt8.29□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.29□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.29□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.29□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.29□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.29□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 SER2YGR208W 930 nt8.29□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 YJR154WYJR154W 1041 nt8.29□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 SRP102YKL154W 735 nt8.28□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 YLR460CYLR460C 1131 nt8.28□□□□□ -1.08
AVL9Q12500 YGR210CYGR210C 1236 nt8.26□□□□□ -1.09
AVL9Q12500 BUB2YMR055C 921 nt8.26□□□□□ -1.09
AVL9Q12500 MIM1YOL026C 342 nt8.26□□□□□ -1.09
AVL9Q12500 PUP1YOR157C 786 nt8.26□□□□□ -1.09
AVL9Q12500 MEX67YPL169C 1800 nt8.26□□□□□ -1.09
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