Protein–RNA interactions for Protein: Q12454

OCA6, Putative tyrosine-protein phosphatase OCA6, yeastyeast

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
OCA6Q12454 AMF1YOR378W 1548 nt8.68□□□□□ -1.02
OCA6Q12454 SFL1YOR140W 2301 nt8.68□□□□□ -1.02
OCA6Q12454 KRE1YNL322C 942 nt8.67□□□□□ -1.02
OCA6Q12454 SUV3YPL029W 2214 nt8.65□□□□□ -1.02
OCA6Q12454 SWT21YNL187W 1074 nt8.65□□□□□ -1.02
OCA6Q12454 KEL3YPL263C 1956 nt8.64□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 THP3YPR045C 1413 nt8.64□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 DUS3YLR401C 2007 nt8.63□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.63□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.63□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 TRP2YER090W 1524 nt8.63□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 MET1YKR069W 1782 nt8.61□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 ORT1YOR130C 879 nt8.61□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 YMR265CYMR265C 1386 nt8.61□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.6□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.6□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.6□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.6□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.6□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.6□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.6□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.6□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.6□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.6□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.6□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 YDR467CYDR467C 327 nt8.6□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 HAP5YOR358W 729 nt8.6□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 PHB2YGR231C 933 nt8.59□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 YKL053WYKL053W 375 nt8.59□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 ADH3YMR083W 1128 nt8.59□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 SLG1YOR008C 1137 nt8.59□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 CRC1YOR100C 984 nt8.59□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 NAM8YHR086W 1572 nt8.59□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 HXT11YOL156W 1704 nt8.59□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 LPD1YFL018C 1500 nt8.59□□□□□ -1.03
OCA6Q12454 ILV2YMR108W 2064 nt8.58□□□□□ -1.04
OCA6Q12454 THI6YPL214C 1623 nt8.58□□□□□ -1.04
OCA6Q12454 GAL2YLR081W 1725 nt8.58□□□□□ -1.04
OCA6Q12454 snR4snR4 186 nt8.58□□□□□ -1.04
OCA6Q12454 LEU2YCL018W 1095 nt8.58□□□□□ -1.04
OCA6Q12454 IPL1YPL209C 1104 nt8.57□□□□□ -1.04
OCA6Q12454 POP2YNR052C 1302 nt8.56□□□□□ -1.04
OCA6Q12454 FSH2YMR222C 672 nt8.56□□□□□ -1.04
OCA6Q12454 SRM1YGL097W 1449 nt8.54□□□□□ -1.04
OCA6Q12454 FLX1YIL134W 936 nt8.54□□□□□ -1.04
OCA6Q12454 YKR012CYKR012C 378 nt8.54□□□□□ -1.04
OCA6Q12454 snR31snR31 225 nt8.52□□□□□ -1.05
OCA6Q12454 ADE16YLR028C 1776 nt8.51□□□□□ -1.05
OCA6Q12454 RPN14YGL004C 1254 nt8.51□□□□□ -1.05
OCA6Q12454 MOB1YIL106W 945 nt8.51□□□□□ -1.05
OCA6Q12454 EMC3YKL207W 762 nt8.51□□□□□ -1.05
OCA6Q12454 YCR025CYCR025C 411 nt8.5□□□□□ -1.05
OCA6Q12454 REX2YLR059C 810 nt8.5□□□□□ -1.05
OCA6Q12454 KGD2YDR148C 1392 nt8.49□□□□□ -1.05
OCA6Q12454 FTH1YBR207W 1398 nt8.49□□□□□ -1.05
OCA6Q12454 SDS24YBR214W 1584 nt8.49□□□□□ -1.05
OCA6Q12454 SAN1YDR143C 1833 nt8.49□□□□□ -1.05
OCA6Q12454 SRP54YPR088C 1626 nt8.48□□□□□ -1.05
OCA6Q12454 ESBP6YNL125C 2022 nt8.47□□□□□ -1.05
OCA6Q12454 AAT1YKL106W 1356 nt8.47□□□□□ -1.05
OCA6Q12454 LYS20YDL182W 1287 nt8.46□□□□□ -1.06
OCA6Q12454 VBA3YCL069W 1377 nt8.46□□□□□ -1.06
OCA6Q12454 GPM1YKL152C 744 nt8.45□□□□□ -1.06
OCA6Q12454 YBL095WYBL095W 813 nt8.45□□□□□ -1.06
OCA6Q12454 PFS2YNL317W 1398 nt8.44□□□□□ -1.06
OCA6Q12454 TOK1YJL093C 2076 nt8.44□□□□□ -1.06
OCA6Q12454 SAM50YNL026W 1455 nt8.43□□□□□ -1.06
OCA6Q12454 YMR210WYMR210W 1350 nt8.42□□□□□ -1.06
OCA6Q12454 TPN1YGL186C 1740 nt8.41□□□□□ -1.06
OCA6Q12454 HSV2YGR223C 1347 nt8.41□□□□□ -1.06
OCA6Q12454 CYC3YAL039C 810 nt8.41□□□□□ -1.06
OCA6Q12454 ENO1YGR254W 1314 nt8.4□□□□□ -1.06
OCA6Q12454 SER2YGR208W 930 nt8.4□□□□□ -1.06
OCA6Q12454 YMC2YBR104W 990 nt8.4□□□□□ -1.06
OCA6Q12454 YLR072WYLR072W 2082 nt8.39□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 YCP4YCR004C 744 nt8.39□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 SWM1YDR260C 513 nt8.39□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 YNL190WYNL190W 615 nt8.39□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 MET30YIL046W 1923 nt8.39□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 DIA4YHR011W 1341 nt8.38□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 SBP1YHL034C 885 nt8.37□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 YLR280CYLR280C 351 nt8.37□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 GAS1YMR307W 1680 nt8.37□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 PTC6YCR079W 1329 nt8.36□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.36□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.36□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.36□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.36□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.36□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 THI3YDL080C 1830 nt8.36□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 ALR1YOL130W 2580 nt8.35□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 ERO1YML130C 1692 nt8.35□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 SRP102YKL154W 735 nt8.35□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 YPT11YNL304W 1254 nt8.35□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 MDH2YOL126C 1134 nt8.35□□□□□ -1.07
OCA6Q12454 HTS1YPR033C 1641 nt8.33□□□□□ -1.08
OCA6Q12454 YFR020WYFR020W 699 nt8.33□□□□□ -1.08
OCA6Q12454 LEA1YPL213W 717 nt8.33□□□□□ -1.08
OCA6Q12454 DTR1YBR180W 1719 nt8.32□□□□□ -1.08
OCA6Q12454 YGR210CYGR210C 1236 nt8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.7 ms